Göteborgs universitet ledigkungör tio doktorandanställningar vid den multidisciplinära
Forskarskolan i havsmiljöforskning
som drivs av Centrum för havsforskning vid Göteborgs universitet (organiserat under Göteborgs Miljövetenskapliga Centrum, GMV). Doktorandanställningarna ingår i fem multidisciplinära projekt, där varje projekt består av en doktorand och en handledare från vardera två fakulteter (discipliner). Forskningen ska stödja ett framtida hållbart nyttjande och en hållbar förvaltning av marina resurser.
Forskarskolan rekryterar doktorander under perioden juni 2011-jan 2012 och kommer fullt utbyggd ha 14 doktorander fördelade över 7 par-doktorandprojekt. Forskarskolan koordineras av en studierektor. Respektive doktorand antas dock vid den institution som handledaren tillhör och examineras enligt institutionens regler. Forskarskolans doktorander och handledare förväntas delta i gemensamma arbetsmöten, seminarier och andra aktiviteter arrangerade av forskarskolan. Inom varje projekt ska de två doktoranderna och deras handledare arbeta tillsammans och det förväntas att minst en del av varje doktorands avhandling speglar den multivetenskapliga inriktningen på projektet. Nedan följer beskrivning av de fem projekten och inom varje projekt beskrivning av de två doktorandanställningarna.
Ansökan
För varje anställning inlämnas separat ansökan. Ansökningar inges elektroniskt till registrator vid Göteborgs universitet, anstallning@gu.se . Ansökan ska vara i en pdf samt bilagor i en separat pdf. De som önskar söka flera av anställningarna i marin ekologi måste lämna in separata ansökningar för varje tjänst. Det ät viktigt är att ange både diarienummer samt vilken av doktorandanställningarna som ansökan gäller.
Ansökan skall vara inkommen till registrator senast måndagen den 5 mars 2012.
Projekt 5: Antibiotikaresistens i marina bakterier: Biociders och metallers roll för att gynna och bibehålla antibiotikaresistens i marin miljö
Den snabba utvecklingen av multiresistenta bakterier är enligt WHO ett av de tre största hoten mot människors hälsa eftersom det kraftig försämrar våra möjligheter att behandla infektionssjukdomar. Bara i Europa avled 25 000 människor av resistenta bakterier i fjol. Huvudorsaken är en utbredd antibiotikaförskrivning. EU har nyligen genom SCENIHR (Scientific Committee for Emerging and Newly Identified Health Risks) uppmärksammat att även andra ämnen såsom biocider och metaller kan gynna spridning av antibiotikaresistens.
De kända molekylära mekanismerna för detta faller huvudsakligen i två kategorier:
- koresistens då gener som kodar för antibiotika-, metall- eller biocidtolerans är samlokaliserade till samma plasmid och därför överförs tillsammans, och
- korsresistens där de enskilda resistensmekanismerna (tex efflux-pumpar) på grund av lägre specificitet kan hantera ämnen av olika slag.
Effektiviteten av såväl resistensmekanismer som spridningsförmåga är avgörande för hur allvarliga konsekvenserna blir.
Selektion som gynnar uppkomst och spridning av metaller (tex koppar och silver), och biocider (tex desinfektionsmedel, antibakteriella ämnen, konserveringsmedel) har således inflytande även på förekomst av antibiotikaresistens. Tidigare har fokus främst varit på antibiotikaanvändning inom sjukvård och veterinärmedicin. Såväl arenor som ansvarsområden expanderar nu. Varje plats där metaller eller biocider används eller förekommer tillsammans med bakterier är nu en potentiell arena där även antibiotikaresistens kan gynnas. Om gynnade gener kan överföras till patogener med stor risk för mänsklig exponering förvärras risken. Av omedelbart intresse ur hälsosynpunkt är därför tex dricksvatten, födoämnen, djurhållning, fiskodlingar, hemmiljö, simhallar. Detta gäller sannolikt även områden med gott hygienarbete (tex offentliga toaletter).
Den marina miljön är den slutliga recipienten för många av de ämnen som kan gynna antibiotika resistens. Förorenade marina miljöer kan därför utgöra en en arena där antibiotikaresistens kan bibehållas och spridas genom indirekta selektionstryck, såsom kopparexponering från antifoulingfärger på båtskrov.Även den yttre miljön är kontaminerad av metaller, biocider och
antibiotika. Selektionstryck från dessa ämnesgrupper – enskilt eller tillsammans – medför att sådana miljöer blir potentiella grogrund för uppkomst eller bibehållande av antibiotikaresistens. Det är väsentligt att omfattningen och mekanismerna bakom dessa processer klarläggs.
Målsättningen är att klargöra (1) vilka antibiotikaresistens-gener (kända eller nya) som förekommer i marina miljöer, (2) om exponering för biocider och metaller selekterar för antibiotika resistens i i marina bakteriesamhällen (3) den genetiska basen bakom sådan kors- eller ko-resistens i marina bakterier (4) om antibiotikaresistensgener gynnas och transporteras på med hjälp av selektionstryck från antifoulingfärger.
Vi kommer att kombinera kontrolerade modellekosystemexperiment med fältstudier i såväl mer som mindre kontaminerade områden. DNA från komplexa bakteriesamhällen analyseras med den nyaste sekvensieringsteknologin (massively parallel next-generation sequencing). Funktionell metagenomik skall användas för att identifiera nya resistensfaktorer. ”Pollution-Induced Community Tolerance” (PICT) utnyttjas för att kvantifiera och utvärdera selektionstryck och kotoleransmönster från metaller, biocider och antibiotika i marina mikrobiella biofilmer.
Avancerade sekvensieringsprotokoll möjliggör upptäckt av genetiskt länkad koresistens. Kompetens och erfarenheter i de två samverkande forskargrupperna, placerar oss i den unika positionen att kunna förena medicin och infektionssjukdomar med marina föroreningar och mikrobiell ekotoxikologi, och mötas i gränsytan mellan mikrobiell ekologi och bioinformatik. Vår forskning kommer att ha stor betydelse för miljömyndigheter, hälso- och sjukvård, och sjöfarten.
5B. Doktorandanställning med inriktning mot medicinsk mikrobiologi eller genomik vid Sahlgrenska akademin
Dnr U 2011/702
Doktorandtjänsten är placerad i Joakim Larssons grupp vid institutionen för neurovetenskap och fysiologi, Sahlgrenska akademin. Sahlgrenska akademin bedriver forskning och undervisning i hälsovetenskap. Larssons grupp bedriver tvärvetenskaplig forskning främst kring spridning och effekter av läkemedel i miljön, tillsammans med flera andra forskargrupper och universitet. En stor del av forskningen rör antibiotikaresistens i den yttre miljön och involverar storskalig DNA sekvensering. Forskargruppen består idag av 12 personer, och forskningen finansieras bland annat av VR, FORMAS, MISTRA och SIDA. För mer information se http://www.neurophys.gu.se/sektioner/fysiologi/endo/joakim_larsson/.
Kvalifikationer
Sökande bör ha antingen en bakgrund inom medicinsk mikrobiologi, eller en inrikting mot genomik, bioinformatik eller motsvarande, lämplig för analys av omfattande dataset av DNA-sekvenser. Vi söker en person med en utomordentlig kommunikationsförmåga, särskilt avseende vetenskaplig kommunikation på engelska, såväl skriftligen som muntligen, ett utvecklat sinne för kreativitet, ett vetenskapligt kritiskt förhållningssätt, såväl som en förmåga att arbeta framgångsrikt i en tvärvetenskaplig grupp. Den sökande skall ha minst 240 högskolepoäng, motsvarande en magisterexamen, varav minst 60 hp på avancerad nivå inom relevant ämnesområde.
Ansökningshandlingar:
- Styrkt meritförteckning (CV).
- Kopia av examensbevis.
- Utdrag av genomgångna universitetskurser med betyg.
- Kopia av examensarbete och eventuella andra vetenskapliga arbeten.
- Referensbrev och kontaktuppgifter till referenspersoner som har kunskap om sökandens tidigare verksamhet.
- En fri beskrivning (1-2 A4-sidor, skriven på engelska) av den sökandes mål och visioner med en forskarutbildning inom den sökta inriktningen. Den sökande bör här speciellt framhålla relevanta skäl för att just hon/han bör bli antagen till den sökta forskarutbildningen.
Huvudhandledare, Docent Joakim Larsson, kan lämna närmare upplysningar om projektets innehåll: E-post: joakim.larsson@fysiologi.gu.se
För generella frågor kring doktorandutbildning vid Sahlgrenska akademin, vänligen kontakta Jessica Nyberg Petterson, E-post: jessica.pettersson@sahlgrenska.gu.se
Fackliga representanter:
- SACO Martin Björkman, 031-786 3608
- SEKO Lennart Olsson, 031- 786 1173
- OFR-S Stefan Schedin, 031-786 1167